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深圳先进院

中国科学院

04-18

2023

ACS Catalysis|鼠李糖脂生物合成新机制：酶晶体结构表征与高通量质谱筛选

研究团队依托深圳合成生物研究重大科技基础设施，首次解析了RhlA的蛋白质晶体结构，意外的发现游离3-羟基脂肪酸可以作为RL生物合成过程的中间体，证实了RhlA具有双重硫酸酯酶和酰基转移酶活性。通过结合半理性设计与高通量质谱筛选，团队获得了底物选择性显著改变的R...
04-17

2023

ACS Synthetic Biology |蛋白质15位点高阶互作实验测量与AI预测

该研究团队依托深圳合成生物研究重大科技基础设施，基于FACS-seq方法表征其序列-功能关系，构建了包含15个位点20个突变的组合饱和突变文库（理论库容量18.4万）。应用机器学习模型，研究团队实现了基于少量低阶（两-两，三-三）突变数据预测15个位点间的高阶...
04-12

2023

Cell Host & Microbe | 噬菌体培养组解析肠道“暗物质”

该工作首次建立了大规模肠道主要共生细菌噬菌体培养组技术，利用噬菌体培养物解析了肠道细菌和噬菌体长期共存的机制，并展示了这些噬菌体在肠道菌群调控中的应用潜力。
04-06

2023

National Science Review | 利用近红外光编程细菌全局表型强化实体瘤治疗效果

通过合成生物学的设计，研究人员成功地将铜绿假单胞菌菌株改造成为具有实体瘤治疗功效的工程菌。在治疗过程中，该工程菌的全局表型可被近红外光的辐照程序精确的控制，即：在弱定殖、定殖以及裂解释药三种表型切换，从而更有效的消融瘤体达到治疗效果，具有巨大的潜在应用价值。
03-30

2023

iScience | 利用模块重组设计新型嵌合抗原受体(CAR)

该工作利用模块重组设计了一系列新型嵌合抗原受体，为肿瘤免疫治疗的改进提供了新的工具包及设计思路。
03-29

2023

mBio | 脚手架蛋白时空互作调控微生物细胞极性发育

该研究发现脚手架蛋白PodJ通过蛋白-蛋白相互作用调控了PopZ的亚细胞定位，其相互作用决定了PopZ在细胞新极的出现时间。抑制PodJ-PopZ的相互作用将引发由PopZ介导的染色体分离出现异常，进而造成细胞周期中染色体分离与细胞分裂的解偶联。
03-23

2023

专家点评Nature Chemical Biology | 定量合成生物学探索细胞命运决定新机制

该研究提出：生长速率可以在全局上调控基因表达网络中每个基因的表达水平从而改变细胞命运，并不一定依赖特定调控因子。该研究为命运决定调控机制研究提供了新视角，也为通过合成生物方法定量控制细胞命运用于医学和工业用途提供了新思路。
03-18

2023

Nature Communications | 模块化和可编程地控制哺乳动物细胞多个基因表达剂量的人工基因线路

该工作通过在哺乳动物构建人工正交转录系统，实现了单个和多个启动子转录活性的精准微调，构建了具有预测能力的多基因表达量的定量热力学模型，并将这个定量模型应用于甲型流感病毒（H1N1）病毒样颗粒（VLP）组分与产量的优化设计。

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