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科研进展
12-12
2023
Nature Communications | IT+BT，罗小舟课题组揭秘酶催化常数预测的“黑科技”！
针对合成生物学和代谢工程领域湿实验测量酶动力学参数成本高、干实验算法难以准确预测等问题，研究团队提出了一种基于预训练大语言模型的统一框架UniKP，可从蛋白质序列和底物结构直接高精度预测酶的动力学参数，包括酶周转数（kcat）、米氏常数（Km）和催化效率（kc...
12-11
2023
Advanced Materials | 深圳先进院阎锡蕴院士团队：利用贵金属-卟啉设计坚固高效的单原子纳米酶用于鼻咽癌的靶向催化治疗
该研究利用贵金属-卟啉系统合成了高活性和稳定的单原子纳米酶。通过锚定在卟啉中心的金属–N原子配位，成功合成了四种贵金属-卟啉（MxP，x代表Pt、Pd、Ru、Ir），以模拟天然过氧化物酶的活性位点。并且设计了一种针对EB病毒相关的鼻咽癌的靶向单原子纳米酶（MI...
12-05
2023
Nature Catalysis | 二氧化碳衍生的低碳原料制备粮食化合物
该研究利用合成生物学和代谢工程手段开发的酵母细胞平台，能将低碳化合物例如甲醇、乙醇、异丙醇等，转化为糖及糖衍生物，包括葡萄糖、肌醇、氨基葡萄糖、蔗糖和淀粉。通过代谢重构和葡萄糖抑制调控，使葡萄糖和蔗糖的产量达到每升数十克。这项研究有助于丰富基于可再生能源驱动的...
12-04
2023
Org. Lett. | 深圳先进院周佳海/古阳团队发展光促羧酸转化的新型工具酶
该研究通过对于光促脱羧酶FAP进行理性设计与定向进化改造，发展了一类新型的光促脱羧酶，实现了对于二级、三级等非天然底物的羧酸进行高效的光促脱羧转化，并应用于药物分子类似物的手性合成中。
12-01
2023
JACS｜深圳先进院周佳海/浙大杜艺岭组合作揭示微生物氧化偶氮类天然产物生物合成的酶学基础
该研究揭示了微生物中氧化偶氮类天然产物关键结构基团生物合成的酶学基础，发现了一个新颖的铁离子依赖型膜结合氮-氮键合酶和一个双铁家族的氧化偶氮合酶。研究结果显示由这两个新家族金属酶共同催化的酶促反应序列可能是细菌中不对称氧化偶氮类天然产物生成的保守策略。
12-01
2023
Nature Communications | Sc3.0重大进展，酿酒酵母染色体臂的精简与合成重构
通过自下而上的设计策略指导酿酒酵母12号染色体左臂（chrXIIL）的深度精简和优化。研究发现仅需20%的天然序列即可支持菌株存活，约45%的天然序列足以恢复菌株的稳健表型；并进而利用显著区别于天然序列的合成型序列构建了可替代内源chrXIIL来支持酵母存活的...
11-29
2023
Metabolic Engineering | 罗小舟团队开发一锅法选择性生物合成Tyrian purple
这项研究针对Tyrian purple在生产上面临化学合成毒性大、海螺提取得率低及生物合成选择性低等问题，研究团队提出了一种简单的一锅法选择性生物合成Tyrian purple的方法，为Tyrian purple在天然染料及生物相容性半导体行业的规模化应用打下...
11-29
2023
Current Opinion in Systems Biology | DNA与基因组合成的最新进展
文章回顾了DNA合成方法与合成基因组的发展历程，介绍了近几年来DNA酶法合成与合成基因组相关工作与应用，并讨论了该领域目前遇到的瓶颈与未来发展方向。
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