Nature合成生物学专辑推荐定量合成生物学全国重点实验室成果:迈向精准生物设计之路

来源:发布时间:2026-05-12

5月6日,国际学术期刊Nature推出“合成生物学”(Synthetic biology)专辑,并刊发专题文章“A Path to High-Precision Biological Design”,关注中国在定量合成生物学领域的研究进展。文章重点聚焦中国科学院深圳先进技术研究院(简称“深圳先进院”)定量合成生物学全国重点实验室(简称“实验室”),指出中国科学家正通过数学模型对细胞行为进行定量刻画,为生命系统的理性设计奠定科学基础。

深圳先进院院长、实验室主任刘陈立研究员是这一领域的重要推动者。近年来,团队提出并持续完善了“定量合成生物学”这一新研究范式,核心思路是让“数学模型”与“实验验证”反复对话、相互校准,从而揭示生命演化背后的定量规律。这一范式正在推动合成生物学从传统的“试错驱动”转向“理性设计”,逐渐成为国际学界共识的重要发展方向。

目前,实验室正重点推进三大策略,一是解析生命本身的设计原理;二是用模块化组件一步步构建生物系统;三是借助人工智能来加快研发速度,优化研发流程。围绕定量合成生物学,Nature选取了实验室三项代表性研究成果进行介绍。

解析生长:建立细胞尺寸调控框架

细胞为什么长到一定大小才会分裂?这是生命科学的基本问题之一。研究团队以大肠杆菌为模型,在不同营养条件下系统测量细胞生长行为。过去的主流模型认为,细胞要长到某个固定大小才开始复制DNA。但这一模型难以解释团队观察到的新现象。通过大量实验数据,团队发现细胞尺寸与“生长速率乘以DNA复制到分裂所用的时间”之间存在清晰的线性关系。基于这一发现,团队建立了新的数学模型,并成功实现对细胞分裂尺寸的精准控制——在不改变生长速度的前提下,通过调节基因表达来“设定”细胞什么时候分裂。这项研究为理解细胞如何调控自身尺寸提供了全新的定量框架,也为未来人工设计合成细胞提供了重要的方法学基础。

定量合成生物学全国重点实验室的研究人员正在量化细胞行为,为合成生命系统的设计提供依据

空间博弈:揭示微生物群体竞争新规律

如果把不同细菌放在同一个培养皿里,它们会怎么竞争、怎么分布?研究团队通过长期演化实验和定量分析,发现了一些反直觉的规律。在一个圆形培养皿上,细菌的“战场”并不均匀。团队发现,在中间拥挤的区域,跑得慢的细菌反而更有优势;而在边缘开阔地带,跑得快的细菌才能占上风。换句话说,空间位置决定了哪种策略更“划算”。基于这一现象,团队提出了一个数学公式,清晰描述了栖息地大小、细菌生长速度和迁移能力三者之间的定量关系。这个公式可以精确预测和调控细菌群体的空间分布,为设计微生物群落的有序结构提供了重要的理论工具。

精准医疗:破解细菌治疗肿瘤的基本原理

用细菌治疗肿瘤的探索已有逾百年历史,虽已开发出多种候选菌株,但实现临床转化的仍较为有限。其关键挑战在于疗效与生物安全性的协同控制,即在增强其肿瘤杀伤能力的同时,有效规避对健康组织的感染风险。实验室团队通过工程化改造细菌,使其在肿瘤中选择性存活,在健康组织中则被快速清除。研究进一步发现,肿瘤微环境中存在一个独特的调控机制,涉及一种名为白细胞介素-10(IL-10)的免疫分子。团队通过结合数学模型与定量实验,揭示了细菌如何“借用”这一机制,在肿瘤内部同时实现既激活休眠的抗肿瘤免疫细胞、又抑制肿瘤内抗菌免疫细胞,从而将治疗效果精准地限制在肿瘤区域。这项研究系统阐明了细菌靶向治疗肿瘤的定量合成生物学机制,填补了该领域的重要理论空白,为开发安全、高效的活菌药物奠定了科学基础,并有力推动了相关生物制造和临床试验的进程。

合成细胞:开启人工生命系统设计新局

面向“人工合成单细胞生命”这一宏伟目标,实验室正系统解决生命系统标准化研究的瓶颈问题。实验室自主建设的合成生物研究全自动化实验平台,已达到全球领先的自动化及综合通量水平,并于2025年进入由建设转运营关键期。目前平台已建成大规模合成生物元件库与菌株资源库,并构建了全链条研发服务矩阵。

合成生物研究重大科技基础设施配备先进的自动化和高通量平台

在持续完善技术体系的同时,实验室还积极推动国际合作,发起成立了合成细胞国际联盟及合成细胞亚洲联盟,探索建立开放包容的协同研究机制。正如刘陈立所言,实验室团队正致力于从无生命的生物大分子出发,构建具备生命基本属性的人工合成细胞,真正实现生命系统的理性设计,并探索其在生物制造与生物医学等方向的应用潜力。

定量合成生物学全国重点实验室长期面向全球引进优秀人才,诚邀相关研究方向科研人员加入,共同推进合成生物学前沿发展。

联系方式:isynbio_hr@siat.ac.cn。

定量合成生物学全国重点实验室

定量合成生物学全国重点实验室(以下简称“实验室”)依托中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所建设,实验室定位面向世界科技前沿,以国家重大战略任务为牵引,聚焦合成生物学缺乏理性设计和高效构建能力的重大挑战,瞄准生命功能涌现定量原理和合成生物使能技术两大研究方向,围绕合成细胞和工程细胞两个重点任务布局,形成合成生命、设计生命的原始创新能力,为生物制造产业变革提供源头创新驱动,发展合成生物技术赋能的下一代生物制造,筑牢全球合成生物学科技制高点。

实验室聚焦“合成细胞”与“工程细胞”两大重点任务,有力支撑国家重大战略需求。牵头承担了中国科学院战略性先导科技专项(B 类)、国家自然科学基金委基础科学中心项目(B类)等国家级重大科技任务,成员作为负责人主持国家重点研发计划项目35项。近五年,团队成员在Cell、Nature、Science及其主要子刊发表高水平论文200余篇,相关成果连续两年入选中国十大科技进展新闻,并荣获省部级以上科技奖励19项。实验室牵头建设“合成生物研究重大基础设施”,重点构建了涵盖设计学习、合成测试与用户检测的三大核心功能平台。实验室积极促进科技成果转化与应用,牵头建设国家生物制造产业创新中心,联合央企、国企及行业龙头企业,构建从原创突破到产业落地的全过程创新链。

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