专家点评Nature Biotechnol. | 王宇团队报道CRISmers+GRAPE-LM RNA适配体进化新范式
核酸适配体(aptamer)由诺奖得主Jack Szostak命名,是一类短的单链DNA(ssDNA)或RNA寡核苷酸,能够折叠形成特定三维结构,并以“结构分子”的方式高亲和力结合蛋白或小分子,从而具备开发成为核酸药物和诊断探针的潜力 (1, 2)。然而,适配体发现长期依赖指数富集的配体系统进化技术(SELEX),通常需要多轮、强人工参与的筛选与优化;更关键的是,在体外简化条件下获得的适配体,亲和力和特异性常常不高,限制了其开发成核酸药物和探针的潜力 (3)。 王宇课题组在既往工作中提出CRISmers(CRISPR/Cas-based aptamers screening system),将适配体筛选从溶液和细胞表面体系推进到细胞内环境,使筛选过程天然包含内源生物学机制,体现了内源折叠构象、相互作用特异性、充分的分子竞争等关键变量,从源头提升生物学相关性 (4, 5)。在CRISmers筛选体系中,每个细胞作为一个独立的物理微单元,其作用类似于微流控液滴,能够有效隔离不同分子间的交叉反应,从而显著降低背景噪音。与此同时,该系统以细胞存活等表型变化作为功能性的筛选输出方式,相较...
2026-02-09